'Mega Man X3' sigue la tradición plataformera de las sagas originales de 'Mega Man' y 'Mega Man X'. Se ubica en un futuro ficticio en el que el mundo está poblado por humanos y unos robots inteligentes llamados Reploids. 6pbw

Durante nuestra aventura, atravesaremos una serie de ocho niveles a medida que ganamos diversos poderes y nos hacemos con el arma especial de los jefes del final del nivel. Se trata del primer juego de la saga en el que Zero es un personaje jugable, además de X.