El caos de la guerra de los Reploids ya es cosa del pasado, pero una nueva amenaza se acerca. Un grupo de radicales ha hackeado el dispositivo de gravedad artifucial de Eurasia, lo que está impidiendo que la colonia espacial se vaya fuera de control y colisione con La Tierra. 6as2h

Únete a Mega Man X y su camarada Zero en una carrera contra reloj en la que tendrán que reunir los trozos del cañón de rayos en menos de veinticuatro horas para detener la aniquilación total del planeta.