Después de varios ataques TimeSplitters repelidos en otros planetas, estas criaturas concentran su próximo movimiento en la destrucción del planeta Tierra. Las fuerzas de inteligencia mundiales han detectado que estos seres malignos utilizan unos cristales extraños para viajar a las diferentes épocas de un planeta. 3r4559

El jugador asume el rol del sargento Cortez, un marine cuya misión es ir a la base enemiga para robar los cristales y usarlos en favor de la humanidad, de tal forma que así evite la creación de los TimeSplitters, y por consiguiente, la guerra que están provocando.